Per fugare ogni dubbio, ho provato a collegare un hd Western Digital RED da 4Tb (WD40EFRX) ad una Pure White E350D (SKU 52036-02-40G).
Non ho provato installazioni o avvio di sistema operativo per questioni di tempo ma il disco è stato immediatamente rilevato con la capacità corretta dal firmware della mobo, sia sul connettore 1 che sul 4.
A questo punto, direi che il problema sono i dischi.