Io avrei usato il secondo disco per fare un backup regolare, piuttosto: Spostare la directory col profilo utente (soprattutto su un sistema nuovo e poco conosciuto come Windows 8) non ti mette al riparo dal medesimo problema, semplicemente lo sposta su un'altra unità.
Detto questo, e premesso che io non mi occupo del supporto di Antec quindi magari vediamo vedo di segnalare la cosa ai mod di sezione, ipotizzo che ci sia un piccolo bug nel software di gestione: Se il software tenta di salvare le impostazioni di regolazione in un sottodirectory del tuo profilo puntandolo col percorso (es: C:\Users\nomeutente\AppData\etc...) invece che usando la variabile d'ambiente %USERPROFILE% allora, avendo spostato la directory, non sarà in grado di trovarla in C:\.
Comunque sia, se ho ragione si può tamponare il problema mettendoci una semplice toppa: Usando il comando "MKLINK" per creare un hard-link alla nuova directory.
Prova ad aprire un terminale (cmd) come amministratore.
Portati in C: (cd C:\) e digita il seguente comando (ovviamente sostituendo "D:\Users" con il percorso corretto):
codice:
mklink /J "C:\Users" "D:\Users"
e riprova a salvare le impostazioni. Se C:\Users esiste già, il comando andrà in errore. Se il profilo utente è stato spostato allora la copia in C: dovrebbe essere eliminata/eliminabile ma se ci posti un "dir" di C: e di D: prima di fare ci togliamo molti dubbi.
Se anche così non dovesse funzionare, disinstalla e reinstalla il software di controllo: Sempre a causa dello spostamento potrebbe non avere creato qualche sottodirectory necessaria.
Ref:
Mklink command: Create symbolic links in Windows 7
[EDIT:
Occhio che lavorare sul contenuto del collegamento (giunzione) vuol dire lavorare direttamente sui files di destinazione. Attento a cancellare/rinominare qualunque cosa!!!