Boh. Io uso sempre e solo tracce singole, flac, e non ho mai notato il problema. Quanto meno, di certo non si presenta sistematicamente.

Che dipenda dalla versione di Perl, o di uno degli "helper" (flac, sox, ecc) o che so io? Penso sia il caso di abilitare i log dettagliati...

BTW, le mie info:

Logitech Media Server Version: 7.9.0 - 1488878280 @ Wed Mar 8 14:09:34 UTC 2017
Operating system: Debian - EN - utf8
Platform Architecture: x86_64-linux
Perl Version: 5.24.1 - x86_64-linux-gnu-thread-multi
Audio::Scan: 0.95
Database Version: DBD::SQLite 1.34_01 (sqlite 3.7.7.1)