Onde evitare questo io ho iniziato a installare il bootloader direttamente nel MBR del disco (ho un disco diverso per ogni sistema operativo ed uno comunque per lo storage ormai il costo è più che abbordabile).

Per scegliere quale sistema operativo avviare uso il tasto F8 al boot della mobo, sulle Asus ti dà la possibilità di scegliere cosa avviare (hdd, cdrom, usb,...). In questo modo posso smontare tutti i dischi che voglio senza preoccuparmi dei bootloader.